O "Caso Roswell" vem sendo objeto de teorias conspiratórias há mais de sete décadas. Em 8 de julho de 1947, o jornal Roswell Daily Record publicou que os militares haviam recolhidos destroços de um disco voador, mas voltou atrás na edição do dia seguinte, afirmando que se tratava de um balão meteorológico. Informações divulgadas posteriormente deram conta de que o fazendeiro local William "Mac" Brazel havia encontrado e oferecido pedaços do tal balão a jornais locais, em troca de dinheiro.
Em 1989, o físico americano Bob Lazar revelou à imprensa que trabalhou na base, e que os cientistas utilizam engenharia reversa para descobrir como os discos voadores funcionam. Poucos anos depois, o ex-agente da CIA Chase Brandon afirmou que teve acesso a um arquivo secreto, onde uma caixa etiquetada como Roswell chamou sua atenção. "Não vou contar exatamente o que eu vi, mas eram fotos e documentos que validaram todas as minhas suspeitas sobre o caso" (de que se tratava realmente de uma nave alienígena com cadáveres de extraterrestres).
De acordo com o investigador britânico Philip Mantle, que continua estudando o assunto, a chave para entender o que ocorreu em 1947 é o major da inteligência do 509º Grupo de Bombardeio do Exército dos EUA Jesse Marcel — o primeiro oficial graduado a chegar ao local do acidente —, que foi incumbido de "recolher pedaços de dispositivos e auxiliar em futuras investigações".
Observação: Uma testemunha chamada Calvin Parker, que foi apresentada a Marcel por um amigo em comum após ela próprio ter sido abduzida por alienígenas, disse que e o major guardou parte do material coletado naquele dia dentro de um aquecedor de água. "Ele me disse que recebeu ordens para dizer que era apenas um balão meteorológico".
Em entrevista ao Daily Mail, Jesse Marcel III e John Marcel afirmaram que o avô foi obrigado a negar que a nave encontrada no local era extraterrestre, mas escreveu em seu diário que pedaços do OVNI exibiam uma "escrita alienígena".
A CIA só reconheceu oficialmente a existência da Área 51 em agosto de 2013. Quatro meses depois, Barack Obama tornou-se o primeiro presidente americano a mencionar o assunto publicamente.